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==feel free to experiment here ==
=== Species added ===


== Collection list ==
Species added between versions 14.5.0-alpha.5 and 14.5.0-alpha.9:


{| border=1 cellspacing=0 cellpadding=5
!width='100px' bgcolor='#CCCCCC'|Name
!width='100px' bgcolor='#CCCCCC'|Formula
!width='200px' bgcolor='#CCCCCC'|Fullname
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Advected
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Dry deposited
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Gas
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Photolyzed
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Wet deposited


  EXPID: OutputDir/GCHP
|-valign='top'
EXPDSC: GEOS-Chem_devel
|ACO3
CoresPerNode: 6
|C3H3O3
 
|Peroxyacetyl radical for APAN
  #===================================================================
|
# Declare collection names and toggle on/off
|
  # by commenting out with a #
|X
  #===================================================================
|
  COLLECTIONS: 'SpeciesConc',
|
              'Aerosols',
   
              'CloudConvFlux',
|-valign='top'
              'ConcAfterChem',
|ACR
              'DryDep',
|C3H4O
              'JValues',
|Acrolein
              'JValuesLocalNoon',
|X
              'LevelEdgeDiags',     
|X
              'ProdLoss',
|X
              'StateChm',   
|X
              'StateMet',     
|
              'WetLossConv',
   
              'WetLossLS',
|-valign='top'
 
|ACRO2
== The SpeciesConc collection ==
|C3H5O4
 
|Peroxy radical from ACR
A sample collection definition section is listed below. You may cut-and-paste this into your <tt>HISTORY.rc</tt> file and edit accordingly.
|
 
|
  SpeciesConc.template:      '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
|X
  SpeciesConc.format:        'CFIO',
|
  SpeciesConc.frequency:      010000
|
  SpeciesConc.duration:      010000
   
  SpeciesConc.mode:          'time-averaged'
|-valign='top'
  SpeciesConc.fields:        'SpeciesConc_?ADV?            ', 'GIGCchem',
|ALK7
 
|C7H16
Here follows a description of diagnostic quantities belonging to the SpeciesConc collection.
|Lumped >= C6 Alkanes
 
|X
{| border=1 cellspacing=0 cellpadding=5
|
|-valign="top" bgcolor="#CCCCCC"
|X
!width="225px"|Diagnostic name
|
!width="225px"|Description
|
!width="125px"|Units
!width="80px"|Wildcards
|-valign='top'
!width="150px"|Simulations
|APAN
!width="100px"|[[List of diagnostics archived to bpch format|Bpch equiv.]]
|C3H3NO5
!width="150px"|Notes
|Peroxyacryloyl nitrate
 
|X
|-valign="top"
|X
|SpeciesConc_<spcname>
|X
|Chemical species concentrations
|X
|mol/mol dry air
|X
|-valign='top'
|APINN
|C10H17NO4
|1st gen organic nitrate from APIN
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|APINO2
|C10H17O3
|Peroxy radical from APIN
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|APINP
|C10H18O3
|Hydroperoxide from APIN
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|AROMCHO
|C5H6O4
|ACCOMECHO from MCM
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|AROMCO3
|C5H5O6
|Lumped aromatic peroxyacetyl radical
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|AROMPN
|C5H5NO8
|Lumped PN from aromatics
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|BPINN
|C10H17NO4
|Saturated 1st gen BPIN organic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|BPINO
|C9H14O
|Ketone from BPIN
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|BPINO2
|C10H17O3
|Peroxy radical from BPIN
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|BPINON
|C9H13NO4
|Saturated 2nd gen BPIN organic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|BPINOO2
|C10H17O3
|2nd-gen peroxy radical from BPIN
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|BPINOOH
|C9H14O3
|2nd-gen peroxide from BPIN
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|BPINP
|C10H18O3
|Peroxide from BPIN
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|BUTN
|C4H7NO4
|C4H6 alkyl nitrate
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|BUTO2
|C4H7O3
|peroxy radical from C4H6
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|C4H6
|C4H6
|1,3-butadiene
|X
|
|X
|
|
|-valign='top'
|C96N
|C9H15NO4
|Saturated 2nd gen monoterpene organic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|C96O2
|C10H17O3
|2nd-gen peroxy radical from APIN
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|C96O2H
|C9H16O3
|Peroxide from APIN 2nd gen
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|EBZ
|C8H10
|Ethylbenzene
|X
|
|X
|
|
|-valign='top'
|GCO3
|HOCH2CO3
|Peroxyacetyl radical for PHAN
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|HACTA
|HOCH2CO2H
|Hydroxyacetic/glycolic acid
|X
|X
|X
|
|X
   
|-valign='top'
|LIMAL
|C10H16O2
|Aldehyde from limonene
|X
|X
|X
|
|X
   
|-valign='top'
|LIMKB
|C10H16O3
|2nd gen ketone from limonene
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|LIMKET
|C10H16O2
|Ketone from limonene
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|LIMKO2
|C10H17O3
|2nd-gen peroxy radical from LIMO
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|LIMN
|C10H17NO4
|Saturated 1st gen limonene organic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|LIMNB
|C10H15NO4
|Saturated 1st gen LIMO organic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|LIMO2H
|C10H18O3
|Acid from LIMO
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|LIMO3
|C10H17O3
|Acylperoxy radical from LIMO
|
|
|X
|
|
   
|-valign='top'
|LIMO3H
|C10H18O4
|Peracid from LIMO
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|LIMPAN
|C10H17NO4
|PAN from LIMO
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|MEKCO3
|C3H5O4
|False
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|MEKPN
|C3H5NO6
|MEK peroxyacetyl nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|MYRCO
|C10H18O3
|Aldehyde or ketone from myrcene
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|PHAN
|C2H3NO6
|Peroxyhydroxyacetic nitric anhydride
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|PIN
|C10H17NO4
|Saturated 1st gen monoterpene organic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|PINAL
|C10H16O2
|Pinonaldehyde
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|PINO3
|C10H17O3
|Acylperoxy radical from APIN
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|PINO3H
|C10H18O4
|Pinonic peracid
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|PINONIC
|C10H18O3
|Pinonic acid
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|PINPAN
|C10H17NO4
|PAN from pinonaldehyde
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|R7N1
|C7H15NO5
|Peroxy radical from R7N2
|
|
|X
|
|
   
|-valign='top'
|R7N2
|RO2NO
|C7 Lumped alkyl nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|R7O2
|C7H15O2
|Peroxy radical from ALK7
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|R7P
|C7H16O2
|Peroxide from R7O2
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|RNO3
|RO2NO
|Lumped aromatic nitrate
|X
|X
|X
|X
|X
|-valign='top'
|STYR
|C8H8
|Styrene
|X
|
|X
|
|
|-valign='top'
|TLFUO2
|C5H7O5
|False
|
|
|X
|
|
|-valign='top'
|TLFUONE
|C5H6O2
|Aromatic furanones
|X
|X
|X
|
|X
|-valign='top'
|TMB
|C8H10
|Trimethylbenzenes
|
|
|
*?ADV?
|X
*?AER?
*?ALL?
*?DRY?
*?FIX?
*?GAS?
*?KPP?
*?PHO?
*?VAR?
*?WET?
|all simulations
|
|
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND45]]
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND47]]
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND48]]
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND49]]
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND50]]
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND51]]
|
|
|}
   
 
|-valign='top'
== Aerosol diagnostics ==
|ZRO2
 
|C7H9O5
  #===================================================================
|RO2 for making lumped aromatic nitrate
# Aerosol optical depth, surface area, number density, and hygroscopic growth
  Aerosols.template:          '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  Aerosols.format:            'CFIO',
  Aerosols.frequency:        010000
  Aerosols.duration:          010000
  Aerosols.mode:              'time-averaged'
  Aerosols.fields:            'AODDust                      ', 'GIGCchem',
                              'AODDustWL1_?DUSTBIN?          ', 'GIGCchem',
                              'AODHygWL1_?HYG?              ', 'GIGCchem',
                              'AODSOAfromAqIsopreneWL1      ', 'GIGCchem',
                              'AODStratLiquidAerWL1          ', 'GIGCchem',
                              'AODPolarStratCloudWL1        ', 'GIGCchem',
                              'AerHygroscopicGrowth_?HYG?    ', 'GIGCchem',
                              'AerNumDensityStratLiquid      ', 'GIGCchem',
                              'AerNumDensityStratParticulate ', 'GIGCchem',
                              'AerAqueousVolume              ', 'GIGCchem',
                              'AerSurfAreaDust              ', 'GIGCchem',
                              'AerSurfAreaHyg_?HYG?          ', 'GIGCchem',
                              'AerSurfAreaStratLiquid        ', 'GIGCchem',
                              'AerSurfAreaPolarStratCloud    ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST1          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST2          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST3'          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST4          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST5          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST6          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaMDUST7          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaSULF            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaBC              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaOC              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaSSA              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaSSC              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaBGSULF          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroAreaICEI            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST1          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST2          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST3          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST4          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST5          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST6          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiMDUST7          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiSULF            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiBC              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiOC              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiSSA              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiSSC              ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiBGSULF          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_AeroRadiICEI            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST1        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST2        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST3        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST4        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST5        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST6        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaMDUST7        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaSULF          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaBC            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaOC            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaSSA          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaSSC          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaBGSULF        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroAreaICEI          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST1        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST2        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST3        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST4        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST5        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST6        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiMDUST7        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiSULF          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiBC            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiOC            ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiSSA          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiSSC          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiBGSULF        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_WetAeroRadiICEI          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_StatePSC                ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAN2O5H2O          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAN2O5HCl          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAClNO3H2O        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAClNO3HCl        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAClNO3HBr        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLABrNO3H2O        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLABrNO3HCl        ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAHOClHCl          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAHOClHBr          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAHOBrHCl          ', 'GIGCchem',
                              'Chem_KhetiSLAHOBrHBr          ', 'GIGCchem',
                              ::
 
== Cloud convective flux ==
 
== The CloudConvFlux collection ==
 
A sample collection definition section is listed below.  You may cut-and-paste this into your <tt>HISTORY.rc</tt> file and edit accordingly.
 
  CloudConvFlux.template:    '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  CloudConvFlux.format:      'CFIO',
  CloudConvFlux.frequency:    010000
  CloudConvFlux.duration:    010000
  CloudConvFlux.mode:        'time-averaged'
  CloudConvFlux.fields:      'CloudConvFlux_?ADV?          ', 'GIGCchem',
 
Here follows a description of diagnostic quantities belonging to the SpeciesConc collection.
 
{| border=1 cellspacing=0 cellpadding=5
|-valign="top" bgcolor="#CCCCCC"
!width="225px"|Diagnostic name
!width="225px"|Description
!width="125px"|Units
!width="80px"|Wildcards
!width="150px"|Simulations
!width="100px"|[[List of diagnostics archived to bpch format|Bpch equiv.]]
!width="150px"|Notes
 
|-valign="top"
|CloudConvFlux_<spcname>
|Mass change due to cloud convection
|kg/s
|
|
*?ADV?
*?DRY?
*?GAS?
*?WET?
|
|
*all simulations
|X
|
|
*[[List of diagnostics archived to bpch format|ND14]]
|
|
*Will be replaced by new flux diagnostics in v11-03
|}
|}


== Concentrations after chemistry ==
=== Species removed===


  # Concentrations after chemistry
Species removed between versions 14.5.0-alpha.5 and 14.5.0-alpha.9:
  ConcAfterChem.template:    '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  ConcAfterChem.format:      'CFIO',
  ConcAfterChem.frequency:    010000
  ConcAfterChem.duration:    010000
  ConcAfterChem.mode:        'time-averaged'
  ConcAfterChem.fields:      'OHconcAfterChem              ', 'GIGCchem', 
                              'HO2concAfterChem              ', 'GIGCchem', 
                              'O1DconcAfterChem              ', 'GIGCchem', 
                              'O3PconcAfterChem              ', 'GIGCchem', 
::


== Dry deposition diagnostics ==
{| border=1 cellspacing=0 cellpadding=5
!width='100px' bgcolor='#CCCCCC'|Name
!width='100px' bgcolor='#CCCCCC'|Formula
!width='200px' bgcolor='#CCCCCC'|Fullname
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Advected
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Dry deposited
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Gas
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Photolyzed
!width='30px' bgcolor='#CCCCCC'|Wet deposited


# Dry deposition flux velocity (per dry deposited species)
|}
  DryDep.template:            '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  DryDep.format:              'CFIO',
  DryDep.frequency:          010000
  DryDep.duration:            010000
  DryDep.mode:                'time-averaged'
  DryDep.fields:              'DryDepVel_?DRY?              ', 'GIGCchem',
                              'DryDepMix_?DRY?              ', 'GIGCchem',
                              'DryDepChm_?DRY?              ', 'GIGCchem',
                              'DryDep_?DRY?                  ', 'GIGCchem',
::
 
== Photolysis diagnostics ==
 
# Photolysis rates (J-values)
  JValues.template:          '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  JValues.format:            'CFIO',
  JValues.frequency:          010000
  JValues.duration:          010000
  JValues.mode:              'time-averaged'
  JValues.fields:            'Jval_?PHO?                    ', 'GIGCchem',
::
# Photolysis rates at local noon (J-values)
  JValuesLocalNoon.template:  '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  JValuesLocalNoon.format:    'CFIO',
  JValuesLocalNoon.frequency: 010000
  JValuesLocalNoon.duration:  010000
  JValuesLocalNoon.mode:      'instantaneous'
  JValuesLocalNoon.fields:    'JNoon_?PHO?                  ', 'GIGCchem',
::
 
== Diagnostics on level edges ==
 
# Level edge diagnostics (73-level only)
  LevelEdgeDiags.template:    '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  LevelEdgeDiags.format:      'CFIO',
  LevelEdgeDiags.frequency:  010000
  LevelEdgeDiags.duration:    010000
  LevelEdgeDiags.mode:        'time-averaged'
  LevelEdgeDiags.fields:      'Met_CMFMC                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PEDGE                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PEDGEDRY                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_PFICU                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PFILSAN                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PFLCU                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PFLLSAN                    ', 'GIGCchem',
::
 
== Production and loss rates ==
 
  # Prod/loss rates
  ProdLoss.template:          '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  ProdLoss.format:            'CFIO',
  ProdLoss.frequency:        010000
  ProdLoss.duration:          010000
  ProdLoss.mode:              'time-averaged'
  ProdLoss.fields:            'PROD_?PRD?                    ', 'GIGCchem',
                              'ProdBCPIfromBCPO              ', 'GIGCchem',
                              'ProdOCPIfromOCPO              ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromH2O2inCloud        ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromO3inCloud          ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromO3inSeaSalt        ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromHOBrInCloud        ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromSRO3              ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromSRHObr            ', 'GIGCchem',
                              'ProdSO4fromO3s                ', 'GIGCchem',
                              'LOSS_?LOS?                    ', 'GIGCchem',
                              'LossHNO3onSeaSalt            ', 'GIGCchem',
::
 
== Fields of the State_Chm object ==
 
# State_Chm array diagnostics (see also Aerosols collection
  StateChm.template:          '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  StateChm.format:            'CFIO',
  StateChm.frequency:        010000
  StateChm.duration:          010000
  StateChm.mode:              'time-averaged'
  StateChm.fields:            'Chem_phSav                    ', 'GIGCchem', 
                              'Chem_HplusSav                ', 'GIGCchem', 
                              'Chem_WaterSav                ', 'GIGCchem', 
                              'Chem_SulRatSav                ', 'GIGCchem', 
                              'Chem_NaRatSav                ', 'GIGCchem', 
                              'Chem_AcidPurSav              ', 'GIGCchem', 
                              'Chem_BiSulSav                ', 'GIGCchem',
                              'Chem_pHCloud                  ', 'GIGCchem',
                              'Chem_SSAlk',                  ', 'GIGCchem',
                              'Chem_HSO3AQ                  ', 'GIGCchem',
                              'Chem_SO3AQ                    ', 'GIGCchem',
                              'Chem_fupdateHOBr              ', 'GIGCchem',
::
 
== Fields of the State_Met object ==
 
# State_Met array diagnostics
  StateMet.template:          '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  StateMet.format:            'CFIO',
  StateMet.frequency:        010000
  StateMet.duration:          010000
  StateMet.mode:              'time-averaged'
  StateMet.fields:            'Met_AD                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_AIRDEN                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_AIRVOL                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_ALBD                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_AREAM2                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_AVGW                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_BXHEIGHT                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_ChemGridLev                ', 'GIGCchem',
                              'Met_CLDF                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_CLDFRC                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_CLDTOPS                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_DELP                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_DQRCU                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_DQRLSAN                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_DTRAIN                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_EFLUX                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_FRCLND                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_FRLAKE                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_FRLAND                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_FRLANDIC                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_FROCEAN                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_FRSEAICE                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_FRSNO                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_GWETROOT                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_GWETTOP                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_HFLUX                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_LAI                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_LWI                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_PARDR                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PARDF                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PBLTOPL                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PBLH                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PHIS                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PMID                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_PMIDDRY                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PRECANV                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PRECCON                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PRECLSC                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PRECTOT                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PS1DRY                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PS1WET                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PS2DRY                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PS2WET                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PSC2WET                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_PSC2DRY                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_QI                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_QL                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_OMEGA                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_OPTD                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_REEVAPCN                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_REEVAPLS                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_SLP                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_SNODP                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_SNOMAS                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_SPHU                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_SPHU1                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_SPHU2                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_SUNCOS                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_SUNCOSmid                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_SWGDN                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_T                          ', 'GIGCchem',
                              'Met_TAUCLI                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_TAUCLW                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_THETA                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_TMPU1                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_TMPU2                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_TO3                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_TropHt                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_TropLev                    ', 'GIGCchem',
                              'Met_TropP                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_TS                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_TSKIN                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_TV                        ', 'GIGCchem',
                              'Met_U                          ', 'GIGCchem',
                              'Met_U10M                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_USTAR                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_UVALBEDO                  ', 'GIGCchem',
                              'Met_V                          ', 'GIGCchem',
                              'Met_V10M                      ', 'GIGCchem',
                              'Met_Z0                        ', 'GIGCchem',
::
 
== Loss of soluble species in cloud updrafts ==
 
# Loss due to convection (per wet deposited species)
  WetLossConv.template:      '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  WetLossConv.format:        'CFIO',
  WetLossConv.frequency:      010000
  WetLossConv.duration:      010000
  WetLossConv.mode:          'time-averaged'
  WetLossConv.fields:        'WetLossConv_?WET?            ', 'GIGCchem',
::
 
== Loss of soluble species in large-scale wet deposition ==
 
# Loss due to rainout and washout (per deposited species)
  WetLossLS.template:        '%y4%m2%d2_%h2%n2z.nc4',
  WetLossLS.format:          'CFIO',
  WetLossLS.frequency:        010000
  WetLossLS.duration:        010000
  WetLossLS.mode:            'time-averaged'
  WetLossLS.fields:          'WetLossLS_?WET?              ', 'GIGCchem',
::

Latest revision as of 19:10, 3 October 2024

Species added

Species added between versions 14.5.0-alpha.5 and 14.5.0-alpha.9:

Name Formula Fullname Advected Dry deposited Gas Photolyzed Wet deposited
ACO3 C3H3O3 Peroxyacetyl radical for APAN X
ACR C3H4O Acrolein X X X X
ACRO2 C3H5O4 Peroxy radical from ACR X
ALK7 C7H16 Lumped >= C6 Alkanes X X
APAN C3H3NO5 Peroxyacryloyl nitrate X X X X X
APINN C10H17NO4 1st gen organic nitrate from APIN X X X X X
APINO2 C10H17O3 Peroxy radical from APIN X
APINP C10H18O3 Hydroperoxide from APIN X X X X
AROMCHO C5H6O4 ACCOMECHO from MCM X X X X
AROMCO3 C5H5O6 Lumped aromatic peroxyacetyl radical X
AROMPN C5H5NO8 Lumped PN from aromatics X X X X X
BPINN C10H17NO4 Saturated 1st gen BPIN organic nitrate X X X X X
BPINO C9H14O Ketone from BPIN X X X X
BPINO2 C10H17O3 Peroxy radical from BPIN X
BPINON C9H13NO4 Saturated 2nd gen BPIN organic nitrate X X X X X
BPINOO2 C10H17O3 2nd-gen peroxy radical from BPIN X
BPINOOH C9H14O3 2nd-gen peroxide from BPIN X X X X
BPINP C10H18O3 Peroxide from BPIN X X X X
BUTN C4H7NO4 C4H6 alkyl nitrate X X X X
BUTO2 C4H7O3 peroxy radical from C4H6 X
C4H6 C4H6 1,3-butadiene X X
C96N C9H15NO4 Saturated 2nd gen monoterpene organic nitrate X X X X X
C96O2 C10H17O3 2nd-gen peroxy radical from APIN X
C96O2H C9H16O3 Peroxide from APIN 2nd gen X X X X
EBZ C8H10 Ethylbenzene X X
GCO3 HOCH2CO3 Peroxyacetyl radical for PHAN X
HACTA HOCH2CO2H Hydroxyacetic/glycolic acid X X X X
LIMAL C10H16O2 Aldehyde from limonene X X X X
LIMKB C10H16O3 2nd gen ketone from limonene X X X X
LIMKET C10H16O2 Ketone from limonene X X X X
LIMKO2 C10H17O3 2nd-gen peroxy radical from LIMO X
LIMN C10H17NO4 Saturated 1st gen limonene organic nitrate X X X X X
LIMNB C10H15NO4 Saturated 1st gen LIMO organic nitrate X X X X X
LIMO2H C10H18O3 Acid from LIMO X X X X
LIMO3 C10H17O3 Acylperoxy radical from LIMO X
LIMO3H C10H18O4 Peracid from LIMO X X X X
LIMPAN C10H17NO4 PAN from LIMO X X X X X
MEKCO3 C3H5O4 False X
MEKPN C3H5NO6 MEK peroxyacetyl nitrate X X X X X
MYRCO C10H18O3 Aldehyde or ketone from myrcene X X X X
PHAN C2H3NO6 Peroxyhydroxyacetic nitric anhydride X X X X X
PIN C10H17NO4 Saturated 1st gen monoterpene organic nitrate X X X X X
PINAL C10H16O2 Pinonaldehyde X X X X
PINO3 C10H17O3 Acylperoxy radical from APIN X
PINO3H C10H18O4 Pinonic peracid X X X X
PINONIC C10H18O3 Pinonic acid X X X X
PINPAN C10H17NO4 PAN from pinonaldehyde X X X X X
R7N1 C7H15NO5 Peroxy radical from R7N2 X
R7N2 RO2NO C7 Lumped alkyl nitrate X X X X X
R7O2 C7H15O2 Peroxy radical from ALK7 X
R7P C7H16O2 Peroxide from R7O2 X X X X X
RNO3 RO2NO Lumped aromatic nitrate X X X X X
STYR C8H8 Styrene X X
TLFUO2 C5H7O5 False X
TLFUONE C5H6O2 Aromatic furanones X X X X
TMB C8H10 Trimethylbenzenes X
ZRO2 C7H9O5 RO2 for making lumped aromatic nitrate X


Species removed

Species removed between versions 14.5.0-alpha.5 and 14.5.0-alpha.9:

Name Formula Fullname Advected Dry deposited Gas Photolyzed Wet deposited
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